Classes

Aula 01 - Biologia do Século XXI

Aula 02 e Aula 03 - Conceito de Vida

Aula 04 - Estrutura e Função de Ácidos Nucleicos (Parte I)

Aula 05 - Estrutura e Função de Ácidos Nucleicos (Parte II)

Aula 07 - Dogma Central (Parte I)

Aula 08 - Atividade: Estrutura Viral I

Aula 09 - Atividade: Estrutura Viral II

Aula 10 - Estratégias Omics

Aula 11 - NCBI

Notas Finais (FFI)

Módulo 1: LUCA e a Origem da Bioenergética Celular (Guia de Leitura)

Aula 01 - Introdução a origem do primeiro metabolismo 

Aula 02 - Via de Wood–Ljungdahl (Parte I)

Aula 03 - Apresentação Coletiva: Aspectos Físicos, Químicos e Biológicos do primeiro metabolismo

Aula 04. Estudo Dirigido e questões de revisão.

Aula 05. Protocolo Computacional I

Aula 06. Revisão do Módulo I

Aula 08, 09 e 10. Metabolismos

Conceitos Finais 

Aula 01 -  Introdução (Jupyter e Strings) [Revisão da Aula 01]

Aula 02 - Introdução (Variáveis e Operadores) [Revisão da Aula 02]

Aula 03 - Introdução (Condicionais e Listas) [Revisão da Aula 03]

Aula 04 - Introdução (Métodos, Dicionários e Funções] [Revisão da Aula 03 com Gabarito]

Bibliografia:

1. Backes, A. (2023). Aprendendo Python: um guia básico de programação.

2. Bonaretti, S. (2025). Learn Python with Jupyter. 

Aula 01 - Apresentação da disciplina

Aula 02 - Teorias da Evolução de Charles Darwin;  Síntese Moderna (Microevolução)

Aula 03 - Microevolução: Introdução aos métodos filogenéticos

Aula 04 - Microevolução: Introdução aos métodos filogenéticos (Prática Computacional)

Aula 05 - Microevolução: Introdução aos métodos filogenéticos (Aprofundamento) 

Aula 05 - Tutorial (Download de sequências do NCBI e NSGPhylogeny)

Aula 06 - Origem da Vida I

Aula 07 - Origem da Vida II

Aula 08 - Macroevolução (Parte I)

Aula 09 - Macroevolução (Parte II)

Estudo Dirigido Prova 2

Conceitos Finais

Aula 01 - Apresentação da disciplina

Aula 02 - Célula Bacteriana (Parte I)

Aula 03 - Célula Bacteriano (Parte II)

Aula 04 - Célula Bacteriana (Parte III)

Aula 05 - Célula Bacteriana (Parte IV)

Aula 06 - Avaliação Formativa I

Aula 07 - ESKAPE (Atividade coletiva)

Aula 08 - Físsão Binária I

Aula 09 - Ciclo Celular Bacteriano Completo I

Aula 10 - Arquitetura do Genoma Bacteriano I

Notas: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1gfN1vWaV_iRbodbFmGU_l4kbJOqLHFaVahQdkPM60SY/edit?usp=sharing

Leitura de Apoio (Módulo II): Leitura de apoio para a próxima prova (Módulo 2)

Conceitos Finais: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1_VpJyQXT2MpoCHdG_44dn-1mBjPeIZtlt5e07ggpYic/edit?usp=sharing

) 

Aula 01 - Introdução

Aula 02 - Biodiversidade (Parte I)

Aula 03 - Biodiversidade (Parte II)

Aula 04 - Biodiversidade (Parte III)

Aula 05 - Biodiversidade (IV)

Aula 06 - Avaliação Somativa I

Aula 07 - Avaliação por pares (peer-review)

Aula 08 - Genômica & Biodiversidade

Conceitos: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1t83s5T7S4Ea60GlElKeR4O7Z6ehvihEWQVzTFQTealA/edit?usp=sharing

Seminários:

Grupo 01 — Filogenômica de Primatas (doi:  https://www.science.org/doi/10.1126/science.abn6919)

Grupo 09 — Dispersão e diversificação dos nativo-americanos nas Américas (doi: https://www.science.org/doi/10.1126/science.aav2621)

Grupo 06 — Da molécula para o genoma com Evo (doi: https://www.science.org/doi/10.1126/science.ado9336)

Grupo 07 — Diversidade críptica de bactérias degradadoras de celulose em humanos (doi: https://www.science.org/doi/10.1126/science.adj9223)

Grupo 05 — Impacto da miscigenação na evolução populacional e saúde brasileira (doi: https://www.science.org/doi/10.1126/science.adl3564)

Grupo 08 — Animais de criação abrigam vírus com potencial de transbordamento zoonótico (doi: https://www.nature.com/articles/s41586-024-07901-3)

Grupo 03 — Diversidade de hospedeiros de zoonoses cresce em ecossistemas dominados por humanos (doi: https://www.nature.com/articles/s41586-020-2562-8)

Grupo 02 — Genetic rescue of Florida panthers reduced homozygosity but did not swamp ancestral genotypes (doi: https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2410945122)

Grupo 04 - 

Aula 01 - Introdução

Aula 02 - Alinhamento (Parte I)

Aula 03 - Alinhamento (Parte II)

Aula 04 - Alinhamento (Parte III)

Aula 05 - Alinhamento (Revisão)

Aula 06 - Práticas de Alinhamento

Aula 07 - Discussão Avaliativa

Aula 08 - RNA-Seq

Aula 01 - Introdução

Leitura obrigatória para a próxima aula: Gómez-Márques (2021). What is life?. Molecular Biology Reports. [Somente as seções What is Life? / My defnition of life / Are viruses alive?]. Tradução pela ferramenta DeepL.

Aula 02 - Discussão de artigo científico

Aula 03 - Célula bacteriana

Leitura obrigatória: Capítulo 1 (Célula e Genomas) [Biologia Molecular da Célula; 3ed]

Aula 01 - Introdução

Aula 02 - Condicionais

Aula 03 - Listas e Métodos

Lista de Exercícios:

Lista 01: Variáveis e Condicionais

Markdown

Bibliografia:

1. Backes, A. (2023). Aprendendo Python: um guia básico de programação.

2. Bonaretti, S. (2025). Learn Python with Jupyter. 

Aula 01 - Introdução

Aula 2 - Conceito de Evolução

Bibliografia:

Leitura Obrigatória para a Aula 02 (Capítulo 15: A Reconstituição da Filogenia)

Leitura Obrigatória para a Aula 03: Evolução - Mark Ridley:

2.6. As taxas de mutação podem ser medidas (pág. 55-56)

2.8. Os genes são herdados em proporções mendelianas características (pág. 58 - 61)

4.1. Na natureza, há uma luta pela sobrevivência (pág. 102 - 119)

5.14.2. A migração atua para unificar as freqüências gênicas entre as populações (pág.160 - 161)

7.1. A deriva genética e a seleção natural podem, ambas, explicar hipoteticamente a evolução molecular (pág. 186 - 191)

Leitura Complementar para a Aula 02: Dewar, Belcher & West (2025). A phylogenetic approach to comparative genomics. Nature Reviews Genetics.

Aula 01 - Introdução

Aula 02 - Bioenergética e Metabolismo (Revisão)

Aula 03 e 04 - Quimiotrofia: a bioquímica da obtenção de energia a partir de reações redox

Aula 05 -  Apresentação Coletiva (Quimiotrofia)